Zudem kommt es in Regionaltopf eins zum Unterfranken-Derby zwischen dem Bayernligisten SV Alemannia Haibach und Regionalligist FC Kickers Würzburg. In Regionaltopf zwei empfängt die SpVgg Selbitz (Bayernliga) den 1. FC Schweinfurt 05 (Regionalliga Bayern). Die SpVgg Bayern Hof (Regionalliga Bayern) fährt zum Sieger des noch ausstehenden Duells ASV Pegnitz (Landesliga) gegen die SpVgg Jahn Forchheim (Bayernliga), das am 24. oder 25. September stattfindet. Regionalligist SV Heimstetten spielt in Regionaltopf drei vor heimischer Kulisse gegen den Drittligisten Wacker Burghausen und der FC Ismaning (Bayernliga) trifft auf den SV Schalding-Heining (Regionalliga Bayern). Aufgrund der weiteren noch ausstehenden Partien der 2. BFV-Hauptrunde zwischen dem FC Memmingen und der SpVgg Unterhaching (25. September, 18:30 Uhr) sowie dem VfB Durach und dem amtierenden Pokalsieger TSV 1860 Rosenheim (25. September, 19 Uhr) werden die Paarungen in Regionaltopf vier erst am 25. September ausgelost. Regelspieltag für das Totopokal-Achtelfinale ist der 3. Oktober.
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Achtelfinale 03.10. 15:00 SV Sportfreunde Dinkelsbühl TSV Nördlingen 03.10. 15:00 SV Alemannia Haibach FC Würzburger Kickers 03.10. 15:00 SpVgg Selbitz 1. FC Schweinfurt 05 01.10. 19:00 SV Heimstetten SV Wacker Burghausen 03.10. 14:00 FC Ismaning SV Schalding-Heining 03.10. 15:00 Sieger Pegnitz / Forchheim SpVgg Bayern Hof