Seine Profi-Laufbahn startete der heute 31-Jährige in der Jugend des SC Freiburg und wurde unter Christian Streich deutscher A-Jugend Meister. In der Saison 2008/2009 wurde Andreas deutscher Zweitligameister und stieg mit dem SC Freiburg in die 1. Bundesliga auf, wo er in der darauffolgenden Saison zwei Mal zum Einsatz kam. Nach den Stationen TuS Koblenz, 1.FC Heidenheim, VfL Osnabrück, 1.FC Saarbrücken, VfL Osnabrück, SC Fortuna Köln und TuS Koblenz wechselte er 2018 zu Wormatia Worms, wo er in der vergangenen Saison 23 Mal zum Einsatz kam. Insgesamt kann Andreas Glockner auf die Erfahrung von zwei Bundesliga-, 39 Zweitliga-, 136 Drittliga- und 109 Regionalligaspiele zurückblicken. Mit Ablauf der vergangenen Saison beendete Andreas seine Profi-Karriere und kehrt nun in seine Heimat zurück. Ganz mit dem Fußball aufhören wollte er jedoch nicht und so kann sich der FC Bad Krozingen über diese Verstärkung für die kommende Landesliga-Saison freuen.
Andreas Glockner ist nach Kevin Egin, Denis Krasniqi (beide Alemannia Müllheim), Ervin Fetahovic (eigene U19), Soumaila Djibrila (SF Eschbach), Patrick Hettig (SC Mengen) und Juri Kuhn (VfR Hausen) der siebte Neuzugang für die historisch erste Landesliga-Saison des FC Bad Krozingen.