Sein Debüt als Profi beim VfB Stuttgart gab Manuel Fischer im Dezember 2007 beim Champions-League-Rückspiel der Stuttgarter in Barcelona. Bei der damaligen 1:3-Niederlage im Camp Nou wechselte ihn VfB-Coach Armin Veh in der 71. Minute ein. Im Jahr darauf unterschrieb der 1,82 Meter große Stürmer einen Profivertrag bis 2011, wurde in dieser Zeit auch zum TuS Koblenz und Wacker Burghausen ausgeliehen.
Weitere Stationien waren FC Bayern München II, Spvgg. Unterhaching, SG Sonnenhof Großaspach, Stuttgarter Kickers, FC 08 Homburg sowie im letzten Jahr die Oberligisten SSV Reutlingen und Tennis Borussia Berlin. Einen Vertrag hat er in diesem Sommer mit dem Futsal-Club TSV Weilimdorf abgeschlossen und will nebenher noch auch normalen Fußball in Maichingen spielen. GSV-Abteilungsleiter Gerd Klauß meinte auf Anfrage: "Der Wechsel ist noch nicht vollzogen, wir müssen uns noch endgültig unterhalten."
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