Den FC Viktoria Köln in der jetzigen Form gibt es erst seit dem 22. Juni 2010. Der Vorgängerverein SCB Viktoria Köln musste am 1. August 2010 Insolvenz anmelden, da war der Nachfolger bereits neu gegründet worden, hauptsächlich um die Jungendabteilung zu retten. Im Februar 2011 wurde schließlich die Seniorenabteilung des FC Junkersdorf in die Viktoria aufgenommen, die so zur Spielzeit 2011/12 in der NRW-Liga antreten konnte. Seitdem hat der Verein es geschafft, bis in die 3. Liga aufzusteigen und sich dort zu etablieren.
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Nachfolgend geben wir einen Überblick über die Trainer, die seit diesem Zeitpunkt für die Viktoria an der Seitenlinie standen, bis zum aktuellen Coach Olaf Janßen, der schon zum zweiten Mal für die Höhenberger tätig ist.
Seit 1.2.2021: Olaf Janßen
24.1.2021 - 1.2.2021: Daniel Zillken (interim)
1.7.2019 - 24.1.2021: Pavel Dotchev
13.5.2019 - 30.6.2019: Jürgen Kohler (interim)
1.7.2018 - 12.5.2019: Patrick Glöckner
2.1.2018 - 30.6.2018: Olaf Janßen
11.12.2017 - 1.1.2018: Roland Koch (interim)
1.7.2016 - 11.12.2017: Marco Antwerpen
1.1.2015 - 30.6.2016: Tomasz Kaczmarek
6.12.2014 - 31.12.2014: Alexander Voigt
24.6.2013 - 6.12.2014: Claus-Dieter Wollitz
22.5.2013 - 23.6.2013: Franz Wunderlich (interim)
31.1.2013 - 21.5.2013: Ralf Aussem
16.11.2012 - 30.1.2013: Wolfgang Jerat
1.7.2011 - 12.11.2012: Heiko Scholz